Physikalische und zelluläre Einflussfaktoren auf das Konformationsgleichgewicht nicht-kanonischer DNS-Strukturen

dc.contributor.advisorWinter, Roland
dc.contributor.authorKnop, Jim-Marcel
dc.contributor.refereeCzeslik, Claus
dc.date.accepted2021-09-02
dc.date.accessioned2021-09-15T13:41:16Z
dc.date.available2021-09-15T13:41:16Z
dc.date.issued2021
dc.description.abstractDesoxyribonukleinsäuren (DNS) bilden in vivo nicht nur die bekannte Doppelhelixstruktur aus, sondern auch verschiedene nicht-kanonische Konformationen. Hierzu gehören die in dieser Arbeit untersuchten G-Quadruplexe, i-Motive und Haarnadelstrukturen. Um Konformationsänderungen unter verschiedenen Bedingungen zu beobachten, wurde auf die Einzelmolekül-Förster-Resonanzenergietransfer (smFRET)-Mikroskopie sowie die Circulardichroismus (CD)-Spektroskopie gesetzt. Ein großer Vorteil der smFRET-Mikroskopie ist die Unterscheidbarkeit gleichzeitig vorliegender verschiedener Konformationen, im Gegensatz zu gängigen Ensemblemethoden, bei welchen das Messsignal einen Mittelwert über die gesamte Probe darstellt. Die Untersuchungsbedingungen deckten hierbei verschiedene Bereiche biologischer Relevanz ab. Untersuchungen unter hohen hydrostatischen Drücken in Verbindung mit verschiedenen Osmolyten, bilden Teilaspekte der Anpassungsmechanismen von Tiefseeorganismen nach und erlauben Rückschlüsse auf thermodynamische Größen wie die molare Volumenänderung einer Konformationsänderung. Der Zusatz von α-Synuclein und Proteinaggregaten erforscht wiederum Mechanismen der Protein-DNS-Wechselwirkungen im Zusammenhang mit neurodegenerativen Krankheiten wie Parkinson und Lewis-Körper Demenz. Weiter konnten Erkenntnisse über die Effekte von flüssig-flüssig phasenseparierten Lösemittelumgebungen gewonnen werden, indem ein Modellsystem aus Polyethylenglykol (PEG) und Dextran genutzt wurde.de
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/2003/40494
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.17877/DE290R-22366
dc.language.isodede
dc.subjectSingle-moleculede
dc.subjectFRETde
dc.subjectG-Quadruplexde
dc.subjectI-Motivde
dc.subjectHochdruckde
dc.subjectDNSde
dc.subject.ddc540
dc.subject.rswkFRETde
dc.subject.rswkDNAde
dc.titlePhysikalische und zelluläre Einflussfaktoren auf das Konformationsgleichgewicht nicht-kanonischer DNS-Strukturende
dc.typeTextde
dc.type.publicationtypedoctoralThesisde
dcterms.accessRightsopen access
eldorado.secondarypublicationfalsede

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